Arbejdsmiljøarbejdet på SDU er organiseret efter linjeledelsesstrukturen.
Det betyder, at på det decentrale niveau varetager din arbejdsmiljøgruppe, bestående af arbejdsmiljøleder (AML) og arbejdsmiljørepræsentant (AMR), de daglige operationelle opgaver vedrørende sikkerhed, sundhed og bistår i lokalområdet ved konkrete arbejdsmiljøforhold.
På centralt niveau er Hovedarbejdsmiljøudvalget (HoAmo), som består af fire arbejdsmiljørepræsentanter, fire arbejdsmiljøledere, to studenterobservatører og rektor som forperson for udvalget. HoAmo varetager de strategiske og overordnede opgaver vedrørende sikkerhed og sundhed på SDU.